肛瘺可以由許多疾病引起，其中比較常見的有以下幾個方面：
一、直腸肛門的損傷：比如外傷、吞咽了骨頭、金屬，肛門進(jìn)行體溫測量以及肛門鏡檢查等損傷了肛管直腸，如果細(xì)菌進(jìn)入傷口即可引起肛瘺。
二、肛周膿腫：當(dāng)肛周膿腫自行破潰或者切開引流后可以造成肛瘺。
三、肛門裂反復(fù)感染也可以形成肛瘺，肛門裂的反復(fù)感染可以并發(fā)皮下瘺。
四、會陰部手術(shù)：產(chǎn)后會陰縫合后的感染以及前列腺尿道手術(shù)后感染等，均可以波及肛門、直腸，引起膿腫肛瘺。
五、腸炎：比如潰瘍性結(jié)腸炎或者克羅恩病并發(fā)的結(jié)腸炎。
六、血行感染：比如糖尿病、白血病以及再生性障礙性貧血等，因為機(jī)體抵抗力降低，常有血行感染引起肛瘺。
七、結(jié)核：結(jié)核病并發(fā)結(jié)核性肛瘺的比較多，甚至可以高達(dá)26%，近年來明顯下降，主要為吞咽結(jié)核菌引起，少數(shù)也可以血行感染進(jìn)行引起。
八、直腸肛管癌：直腸肛管癌布及身部可以并發(fā)肛瘺。
九、還有些其他原因：包括淋巴肉芽腫、放射菌病、骨髓炎、直腸乙狀炎也可以引起直腸肛門膿腫以及瘺。
