治療尿路感染的常用抗菌藥物有磺胺類，胺類，頭孢菌素類，氨基糖苷類，以及喹諾酮類等藥物。
選擇抗菌藥物時應該考慮以下問題：
一，選用對致病菌敏感的藥物，一般在尿培養(yǎng)結果和藥敏實驗結果時，應該選用對革蘭陰性桿菌有效的抗菌素，因尿路感染大多數(shù)是由于大腸桿菌的革蘭陰性菌所引起，尤其是首發(fā)尿路感染多數(shù)是可以治愈，如治療三天，癥狀無改善，則應該按藥敏實驗結果來選藥。
二，抗菌藥物在腎內和尿中的濃度要高，膀胱炎膀胱的淺層黏膜感染，僅要求抗菌藥在尿中有高濃度，腎盂腎炎是指深部感染，因此要求抗菌藥物在尿內和血中均有較高的濃度，對于腎盂腎炎應該選用殺菌劑。
三，選用對腎損害小，不良反應也小的抗菌藥物，治療尿路感染過程中應該盡可能地避免使用有腎毒性的抗菌藥物，特別是對腎功能不全者，應該特別注意。
四，聯(lián)合用藥，聯(lián)合用藥僅僅限于嚴重的感染，一般用于：1，藥物治療失敗；2，嚴重感染；3，混合感染；4，耐藥菌出現(xiàn)。
五，確定治療療程，表現(xiàn)為下尿路感染癥狀者予單機療法，或者是三天療程，對有腎盂腎炎療程表現(xiàn)者給予十四天療法。
