藥物治療是生殖器結(jié)核治療的根本，其他的包括手術(shù)在內(nèi)的任何治療方法必須在藥物治療的基礎(chǔ)上進(jìn)行，男性泌尿生殖系統(tǒng)結(jié)核菌近六個月規(guī)則的抗結(jié)核治療以后復(fù)發(fā)率為1%，但僅僅選擇手術(shù)治療后復(fù)發(fā)率為12%到24.5%，所以主張藥物治療為主。
男性生殖器結(jié)核的抗結(jié)核藥物的治療和肺結(jié)核腎結(jié)核相同，必須遵循合理化的治療原則及聯(lián)合規(guī)律全程使用敏感的藥物。
現(xiàn)代的短程抗結(jié)核藥物方案在所有的結(jié)核都有效，因此生殖器的結(jié)核的標(biāo)準(zhǔn)方案是六個月的短程化療，單一性的早期的結(jié)合前列腺精囊結(jié)核，一般采取六個月的治療即可以治愈。
但是對于復(fù)發(fā)性的結(jié)核合并有肺結(jié)核合并免疫制劑際或者是艾滋病的患者鞏固階段應(yīng)適當(dāng)延長，總療程需要九到十二個月，在抗結(jié)核藥物治療期間應(yīng)該定期的做尿常規(guī)，結(jié)核分枝桿菌的培養(yǎng)，結(jié)核分枝桿菌的耐藥試驗(yàn)，靜脈尿路造影以便觀察治療效果。
