?牙頜畸形的發(fā)生過程，可能由單一因素及單一機(jī)制起作用，也可能是多種因素，或多種機(jī)制共同作用的結(jié)果。從錯頜畸形形成的時間上來劃分，錯合畸形的病因，可分為先天性因素和后天性因素兩大類。但是針對個體錯頜畸形發(fā)生機(jī)制的角度來說，錯頜畸形的病因，可分為內(nèi)在的遺傳因素和外界的環(huán)境因素。
錯頜畸形的遺傳因素，來源于種族演化和個體發(fā)育。種族演化主要是人類在數(shù)十萬年的進(jìn)化過程中，隨著食物性質(zhì)的改變，逐步導(dǎo)致人體咀嚼器官產(chǎn)生退化。在咀嚼系統(tǒng)的退化程度方面，咀嚼肌退化程度最大，頜骨次之，牙齒最小。
頜骨與牙齒退化程度不一致，導(dǎo)致牙量和骨量的不協(xié)調(diào)，牙齒產(chǎn)生擁擠，錯合畸形由此出現(xiàn)。個體發(fā)育與其它遺傳特征一樣，錯合畸形也可以由親代遺傳給子代。父母雙方牙合形態(tài)差異較大者，子代通常更容易患錯頜畸形。遺傳因素在錯頜畸形的病因中占比生較高。
環(huán)境因素包括疾病因素，口腔不良習(xí)慣，兒童替牙期常因局部障礙造成錯頜畸形。
